Zellforschungssoftware Simi BioCell

Mit Simi BioCell ist es möglich, die gesamte Entwicklung eines Embryos zu erfassen, zu verfolgen und objektiv zu dokumentieren. Beginnend mit einzelnen Zellen, reichen die Möglichkeiten von Simi BioCell bis zur Studie der gesamten zellulären Entwicklung eines vollständigen, komplexen Lebewesens. Die schnelle, softwarebasierte Datenerfassung und Analyse ist eine wissenschaftliche Argumentationsbasis mit einer fundierten Datenbankdokumentation. Die Erfassung basiert auf mikroskopischen Videoaufnahmen der Zellentwicklung. Dabei lassen sich mit entsprechenden Aufnahmen auch Tiefeninformation verarbeiten. Simi BioCell und die Arbeitsmethoden wurden mit der Unterstützung von Prof. Dr. Ralf Schnabel an der Technischen Universität Braunschweig (Institut für Genetik) entwickelt und im langjährigen, praktischen Einsatz erfolgreich getestet. Vorteile von Simi BioCell - einfache und zügige Datenerfassung im Videobild mit der Maus - diverse Hilfsmittel zur Erfassung wie Kollisionserkennung, zeitliche Fixpunkte etc. - beliebiges Referenzprojekt als Ausgangs- und Vergleichsbasis neuer Projekte - direkter Vergleich mehrerer Projekte - farbliche Gruppierung von Zellen - Datenexport und Datenimport möglich Vielfältige Bild- und Videoquellen: - Videodateien (AVI) - Einzelbildsequenzen (TIFF) - Unterstützung von Wavelet-Kompression (LuraWave) - analoge Bilddaten über geeignete Hardware - optionale Recordersteuerung über RS-232-Schnittstelle Darstellungsmöglichkeiten - detaillierter Teilungsbaum - sowohl zwei- als auch dreidimensionale Ansichten von Zellpositionen, Zellwegen und Mitosen - flexible Auflistung und Filterung nach Zellnamen, Zelleigenschaften, Zeitpunkten In Simi BioCell werden Videos aus speziellen Mikroskopkamerasystemen verwendet. Diese werden in Simi BioCell eingelesen. Dabei können sowohl Einkanal- als auch Mehrkanalsysteme verwendet werden.